En el hipotiroidismo cogénito estas dosis deben ajustarse con el objetivo de mantener la T4 libre en la mitad superior del rango de normalidad en 1-2 semanas, y la TSH dentro de la normalidad en 1 mes (tras inicio o cambio de dosis). Para ello, los controles clínicos y de hormonas tiroideas deben realizarse:

Tras inicio de la terapia: en 1-2 semanas (para T4L libre)
Al mes(para TSH)
Primer semestre: cada 1-2 meses
Segundo semestre: cada 3 meses
De 1 a 3 años: cada 3-4 meses
A partir de los 3 años: cada 4-6 meses
Además, debe realizarse un control extra tras 4-6 semanas de cualquier cambio de dosis.